在軟件企業業績不斷向好的同時，三季報的其他一些數據也揭示了企業發展中的一些隱憂，如主營業務收入普遍增長乏力、上市公司利潤更多來自于資產價格的上漲等。
至10月31日，2009年前三季度國內軟件產業運行經濟數據和軟件上市公司財報全部出爐，企業業績分化明顯，喜憂參半，但不改國內軟件業中期向好趨勢。
產業收入增速持續回落，分化漸趨明顯
10月30日，工信部網站發布了“2009年前三季度電子信息產業運行分析及形勢展望”，稱我國軟件產業增速回落，增速比去年同期下降12個百分點，比一季度下降4個百分點。
1－9月，我國軟件產業累計完成軟件業務收入6775億元，同比增長20．3％，增速比1－8月和一季度分別回落0．7和4個百分點，比去年同期低11．9個百分點。具體主要數據如下：
1－9月，國內軟件產品收入增速趨緩，全行業共完成軟件產品收入2366．7億元，占軟件產業總收入的34．9％，同比增長21．1％，增速比去年同期低13．3個百分點；軟件技術服務收入1483億元，增勢較明顯，同比增長28．5％，占總收入比重21．9％，比去年同期提高了1．4個百分點；再者，嵌入式軟件收入1178．7億元，同比增長15．3％，但仍低于去年同期增速9．9個百分點；還有，系統集成收入1573．4億元，同比增長17．3％，低于去年同期增速11．1個百分點；IC設計業收入173．1億元，同比增長6．5％，增速也低于去年同期15．6個百分點。
上市公司業績總體回升，差異拉大
從工信部數據整體來看，國內軟件企業三季度收入增速雖平穩，但仍在放緩，各軟件上市公司業績差異逐漸拉大。
業績持續出現高增趨勢，表現較好的包括：大都是10月30日在創業板上市的7家軟件公司，三季報亮麗。其中鼎漢技術三季報主營收入17506．43萬元，同比增274．52％，凈利潤4445．26萬元，同比增903．70％；神州泰岳三季報主營收入50172．43萬元，同比增55．31％，凈利潤19414．99萬元，同比增178．34％；華星創業三季報主營收入9775．27萬元，同比增40．93％，凈利潤1570．32萬元，同比增171．66％。另外四家創業板上市公司寶德自動化、銀江電子、網宿科技、立思辰科技，凈利潤也都同比增45％以上。
國內軟件業龍頭用友軟件三季報業績也良好，主營收入125582．65萬元，同比增23．26％，凈利潤34875．58萬元，同比增238．53％。但扣除投資收益，用友凈利可能就少了許多。恒生電子主營收入40652．63萬元，同比增0．61％，但凈利潤12358．24萬元，同比增51．81％，主要是去年低基數影響，費用支出超出市場預期。
業績比較穩定，但尚未出現明顯好轉的包括：東軟集團，其主營收入268880．15萬元，同比增7．69％，凈利潤38485．42萬元，同比增32．21％。但剔除聯通投資收益，主業凈利增長在10％左右，目前東軟外包業務已觸底但尚未反彈。
業績表現不佳，增速下滑明顯有：浪潮軟件，主營收入23441．84萬元，同比減－25．13％，凈利潤1529．17萬元，同比減－18．89％；中國軟件，主營收入151032．58萬元，同比增1．24％，凈利潤275．69萬元，同比減－90．29％；南天信息主營收入104582．61萬元，同比減－16．65％，凈利潤4704．16萬元，同比減－20．31％；海隆主營收入12784．87萬元，同比增1．44％，凈利潤1289．57萬元，同比減－38．75％，等等。
展望第四季度，國內經濟好轉，內需強勁，新行業政策出臺，IT下鄉加速等利好因素，將推動軟件業走出低谷，提高行業整體業績向好。一方面國內ERP需求將進一步提升，有望推動用友軟件、浪潮等企業全年收入，增速將進一步提高；另一方面，全球經濟復蘇，外包業務開始反彈，可帶動東軟、海隆等外包型企業，全年業績實現更好增長。
中期前景可觀，但挑戰仍不小
雖然國內軟件業面臨新起點，中期前景可觀，發展速度仍將加快，但目前總體形勢尚不容樂觀，對絕大數軟件企業而言，未來企業所面臨的問題與挑戰仍然較大。
勿庸諱言，經濟危機沖擊下，也暴露今天軟件行業不少問題：一是核心技術基礎仍較低。發展模式對外依存度高，關鍵技術和元器件受制于人，應對沖擊能力差；二是外包需求依然不穩定。世界經濟仍未完全走出衰退期，根據國際市場調查機構預測，明年世界經濟增速仍然不會超過前幾年，全球貿易不容樂觀。預計四季度起全球市場才開始止住下滑勢頭，明年市場將比今年略有增長；三是國際產業競爭態勢日趨加劇，給中國軟件業帶來新壓力。為應對國際金融危機，各國加大對軟件產業的戰略投入。
業內專家認為，在金融危機尚存下，首先國內軟件企業應全面推進核心技術的開發與占有，建立獨立自主的產業發展模式；其次，在保持原有市場優勢地位的情況下，積極向新興市場轉移，以尋找新利潤增長點，如有條件，要做好并購國外軟件外包企業的準備，加速自身全球業務部署和業務擴展的進程；再者，進一步升級和轉型客戶服務經營體系，建立一種和以往不同的以客戶為心、集市場、定價、服務、研發、技術和支持于一身的全套IT體系構架，搶占、鞏固市場。
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